Јачање напора за ретке болести у Шпанији и Европи: вештачка интелигенција удружује снаге са породицама и удружењима

  • Алат UNED-а и Заједнице Мадрида користи вештачку интелигенцију за откривање 19 ретких болести у педијатријским картонима.
  • Модели вештачке интелигенције попут popEVE и нове методологије системске биологије убрзавају дијагнозу и истраживање.
  • Удружења и пацијенти у Шпанији и у Европском парламенту захтевају већу координацију, ресурсе и равноправност у нези.
  • Локалне самоуправе, фондације и локални субјекти јачају директну подршку породицама које живе са ретким болестима.

Људи и здравствена заштита, ретке болести

За многе породице, живот са ретком болешћу значи суочавање са дугим, неизвесним и бирократским медицинским путем , где дијагноза може трајати годинама. У међувремену, посете, тестови и упућивања се гомилају, а осећај боравака у мраку постаје све тежи.

Истовремено, у Шпанији и широм Европе, обликују се нови алати вештачке интелигенције, најсавременији истраживачки пројекти и мреже подршке грађанима , а све то има за циљ да олакша овај пут. Од алгоритама способних да читају хиљаде медицинских картона до удружења која се боре против бирократије, екосистем ретких болести почиње да добија замах.

Шпанска вештачка интелигенција способна да открива ретке болести у педијатријским картонима

Један од најупечатљивијих напредака долази од Националног универзитета за образовање на даљину (UNED) , у сарадњи са Министарством здравља региона Мадрид. Тим са Одељења за рачунарске језике и системе развио је алат вештачке интелигенције способан да идентификује и класификује 19 ретких болести у клиничким извештајима деце која су прегледана у примарној здравственој заштити.

Студија, објављена у часопису „Scientific Reports“ , користи скоро 250.000 стварних клиничких белешки које су написали педијатри као полазну тачку . То су текстови писани у свакодневној пракси, без шаблона или потпуно стандардизоване терминологије, што знатно компликује њихову аутоматизовану анализу.

Да би се решила ова сложеност, истраживачи су дизајнирали хибридни систем који комбинује напредне лингвистичке технике са језичким моделима заснованим на Трансформер архитектурама , истим архитектурама које су основа многих данашњих најмоћнијих алата за обраду природног језика.

У првој фази, вештачка интелигенција врши неку врсту „аутоматског скрининга“: претражује текстове тражећи могуће помињање ретких болести – од ретких генетских синдрома до веома ретких метаболичких поремећаја – и обележава оне фрагменте са највећом вероватноћом да садрже релевантан случај.

Ово почетно филтрирање се ту не зауставља. Одабране белешке се затим прослеђују специјалистима, који ручно прегледају записе и проверавају да ли испуњавају критеријуме Државног и Регионалног регистра ретких болести . Захваљујући овом заједничком напору између технологије и клиничке праксе, креирана је архива од приближно 1.900 анотираних медицинских историја, један од најопсежнијих ресурса доступних на шпанском језику за ове врсте патологија.

Резултати су обећавајући: најнапреднији модели су тачни у више од 78% случајева , што је метрика која комбинује колико је пацијената откривено и колико их је правилно идентификовано. Ово је побољшање од више од десет процентних поена у поређењу са претходним системима, посебно релевантно у области где су подаци оскудни и веома хетерогени.

Ова прецизност се заснива на веома финој адаптацији клиничког шпанског језика : систем разликује потврђене дијагнозе и породичну историју, обрађује негације (на пример, када лекар искључи болест) и у стању је да детектује индиректне помињања која би, на први поглед, могла проћи незапажено.

подршка и истраживање ретких болести

Од једноставног речника до вештачке интелигенције која разуме медицински језик

Иза овог система лежи значајна количина претходног лингвистичког „водовода“. Тим UNED-а је почео са речником који садржи више од 9.000 ретких болести и њихових варијанти , састављеним из Orphanet-а, главног међународног репозиторијума специјализованог за ове патологије.

У клиничкој пракси, иста болест може бити написана на много начина: као властита именица, као акроним, кроз опис симптома или чак мешањем енглеских и шпанских термина . Да би обухватили сву ову варијабилност, истраживачи су генерисали речник од скоро 21.000 еквивалентних израза.

На основу тих информација, вештачка интелигенција је скенирала медицинске белешке, тражећи кључне фрагменте са клиничким именицама и придевима који би могли да одговарају било којој од тих болести. Алгоритам за екстракцију фраза помогао је у смањењу шума, омогућавајући систему да се фокусира на заиста релевантан садржај.

Затим, на сцену ступа механизам упаривања „вреће речи“ , који омогућава идентификацију патологије чак и ако се ред речи променио или постоје мале варијације у правопису. Ово је корисно, на пример, када педијатар описује синдром без строгог придржавања упутства из приручника.

Да би се избегли лажно позитивни резултати, процес укључује посебна правила за одбацивање двосмислених помињања или сумњивих акронима , као и модул за откривање порицања и други за породичну историју. Идеја је да се избегне рачунање детета као случаја ако лекар само искључује болест или се позива на рођака који је има.

Клиничка валидација и креирање банке стварних случајева

Након што су белешке кандидата одабране, пројекат је ушао у спорију, али кључну фазу. Група од четири здравствена стручњака појединачно је прегледала медицинске картоне како би потврдила да ли, поред поменутог, пацијент испуњава званичне дијагностичке критеријуме за ретку болест.

Резултат је пажљиво анотиран скуп података, са 1.900 медицинских картона груписаних по пацијенту и класификованих у 19 болести или категорију одбачених случајева. Ова врста материјала је непроцењива за научну заједницу јер омогућава обуку и процену нових модела вештачке интелигенције у области где, по дефиницији, случајева никада нема много.

Анализа је такође открила добро познати образац у овој области: неке патологије имају далеко више записа од других , тако да док одређене дијагнозе имају стотине примера, друге се појављују само неколико пута. Ова неравнотежа компликује ствари и за алгоритме и за клиничаре и један је од главних изазова за проширење употребе вештачке интелигенције на цео спектар ретких болести.

Упркос овим ограничењима, истраживачи наглашавају да овај приступ отвара врата интеграцији вештачке интелигенције у рутинске процесе јавног здравља, на пример подржавањем тимова примарне здравствене заштите у систематском читању хиљада клиничких белешки које се тренутно прегледају ручно.

Јачи записи и боље координисан надзор

Пројекат UNED је усклађен са иницијативама као што је Мадридски регионални регистар ретких болести (SIERMA) , који промовише Генерални директорат за јавно здравље заједнице. Основна идеја је јачање ране идентификације случајева на нивоу примарне здравствене заштите и побољшање епидемиолошког праћења.

Имање аутоматизованих алата не значи замену стручњака, већ подршку њиховом раду у понављајућим и скрининг задацима . На средњи рок, системи овог типа би могли помоћи у откривању образаца, покретању раних упозорења или идентификацији географских подручја где су одређене дијагнозе концентрисане.

Према ауторима, овакви развоји постављају темеље за проактивнији приступ здравственој заштити за болести са ниском преваленцијом , посебно код педијатријске популације. Истовремено, олакшали би добијање квалитетнијих података за истраживање и планирање ресурса.

Вештачка интелигенција ће тумачити ретке генетске варијанте

Дијагностиковање многих ретких болести подразумева дешифровање шта се дешава у ДНК сваке особе. Проблем је што сви носимо хиљаде генетских варијанти , а само неколико је заправо одговорно за болест.

Међународни тим повезан са Медицинским факултетом Харварда развио је модел вештачке интелигенције, назван popEVE , који има за циљ да разјасни ову ситуацију. Алат додељује свакој варијанти оцену тежине калибрисану за све гене , омогућавајући истраживачима да дају приоритет генима који су највероватније иза симптома пацијента.

Да би се ово постигло, модел интегрише еволуционе информације, моделе језика протеина и податке о генетици људске популације . Ова комбинација обједињује у једну платформу оно што је раније било решавано помоћу неколико различитих алата.

У студији објављеној у часопису Nature Genetics , истраживачи су показали да popEVE може да разликује патогене варијанте од бенигних варијанти , да разликује мутације повезане са болестима које се јављају у детињству или одраслима, па чак и да идентификује да ли је варијанта наследна или се јавља спонтано, без увођења релевантних пристрасности због географског порекла.

Модел је тестиран на приближно 30.000 пацијената са тешким развојним поремећајима и без јасне дијагнозе . У око трећини случајева, пружио је дијагностички вредне информације и идентификовао 123 варијанте повезане са развојним абнормалностима које раније нису биле повезане ни са једном болешћу; више од двадесет ових гена су већ потврдиле друге истраживачке групе.

Поред дијагнозе, popEVE нуди трагове за нове терапијске циљеве идентификујући које генетске промене најзначајније мењају функцију протеина. Аутори интегришу своје резултате у јавне базе података као што су ProtVar и UniProt, како би клиничари и истраживачи широм света могли имати користи од њих.

Нове методологије за разумевање укључених протеинских мрежа

У Шпанији се такође промовишу иновативни приступи из системске биологије. Група истраживача са Универзитета у Малаги (SIBIUMA група) , у сарадњи са CIBERER-ом и Националним институтом за биоинформатику, представила је методологију за анализу сложених интеракционих мрежа између протеина повезаних са ретким болестима.

Аутори упоређују ове мреже са великом „друштвеном мрежом“ где је сваки протеин особа , а интеракције су њена пријатељства. До сада су многе методе присиљавале сваки протеин да припада само једној заједници, превише поједностављујући стварност у којој један молекул може бити укључен у неколико биолошких процеса истовремено.

Нова стратегија омогућава протеинима да истовремено припадају вишеструким функционалним групама , што је сличније ономе што се дешава у стварном животу када неко има више кругова пријатеља. Ово помаже у идентификацији протеинских модула који би могли бити укључени у различите манифестације исте ретке болести или у сложене коморбидитете.

Ови методолошки напредци отварају врата новим дијагностичким и терапијским стратегијама , јер олакшавају лоцирање кључних тачака у мрежи где би фармаколошка интервенција могла имати већи утицај.

Европа расправља о томе како боље координирати негу епилепсије и ретких болести

Само технолошке иновације нису довољне без пратећих промена у здравству и друштвеној организацији. Европски парламент је био домаћин састанка „Епилепсија и ретке болести: Од силоса до синергије “, који су организовали Шпанска федерација за епилепсију (FEDE) и Међународни биро за епилепсију (IBE).

Догађај је окупио представнике институција, организације пацијената, клиничаре и компаније како би позвали на политике које узимају у обзир посебности епилепсије и ретких болести , као и на побољшање координације између земаља и европских институција.

Међу представљеним примерима , истиче се EpiAlliance , шпанска иницијатива која окупља научна друштва, удружења пацијената и сарадничке субјекте са јасним циљем: изградња кохерентнијег модела неге усмереног на стварне потребе људи са епилепсијом . Овај колаборативни приступ позиционира Шпанију као потенцијални пример за праксе које се могу пренети на друге европске здравствене системе.

Учесници су повезали ове напоре са Глобалним међусекторским акционим планом за епилепсију и друге неуролошке поремећаје (IGAP) Светске здравствене организације . FEDE је овај међународни документ преточио у мапу пута са 22 конкретна и реална подциља , развијена у кратком временском периоду захваљујући необично високом нивоу сарадње.

Федерација наглашава да се људи са епилепсијом у Европи и даље суочавају са три хитне потребе: приступом, разумевањем и равноправношћу . Изазов није ограничен само на дијагнозу или лечење; он такође обухвата друштвену стигму, емоционални утицај и тешкоће у приступу благовременој и одговарајућој специјализованој нези.

Удружења на првој линији фронта: од жалби до конкретних услуга

Док се расправља о главним стратегијама, управо су локалне организације те које пружају неопходну подршку породицама на терену. У граду Елче , Удружење за ретке болести и ментално здравље (AERELX) јавно је осудило недостатак ефикасне подршке домаћинствима која се суочавају са екстремним ситуацијама везаним за ретке болести и проблеме менталног здравља.

Организација препричава недавни случај исцрпљене мајке која се сама суочава са бирократском ноћном мором , упркос томе што је тражила помоћ од разних јавних служби. AERELX описује ове породице као „оне које се не уклапају“ у стандардне системе, на крају постајући терапеути, неговатељи и медицинске сестре без предаха или довољне подршке.

У свом саопштењу, удружење проблем ставља у шири контекст, обележен порастом самоубистава адолесцената и недостатком сразмерних одговора владиних агенција. Они захтевају веома специфичне ресурсе: дневне центре, програме палијативне неге, терапеутске просторе, тимове за брзу интервенцију и политике превенције које иду даље од пуких кампања за односе с јавношћу.

Основна порука је јасна: овде се не ради о тражењу услуга, већ о захтевању права . AERELX нас подсећа да иза сваког случаја стоје животи у опасности и обећава да ће наставити да подржава оне којима је помоћ потребна, истовремено упозоравајући да неће престати да пријављује сваки случај на који институције не одговоре.

Улога локалних већа: пример Мазарона

На локалном нивоу, нека градска већа јачају своју посвећеност ретким болестима. Градско веће Мазарона (регија Мурсија) потписало је нови споразум о сарадњи са Удружењем за ретке болести D'Genes , са циљем консолидације директне подршке људима са ретким, недијагностикованим или инвалидним стањима у општини.

Споразум укључује финансијски допринос општине за подршку услугама као што су социјалне услуге, логопедска терапија, образовне интервенције, когнитивна стимулација, психолошка подршка и музичка терапија . Према организацији, више од 60 породица у општини има користи од ових специјализованих ресурса.

За градско веће, споразум гарантује персонализованију и професионалнију негу за погођене. За Д'Џенеса, он представља спасилачку куцну која обезбеђује континуитет центра за директну негу и спречава да кључни пројекти у заједници зависе искључиво од једнократног финансирања.

Ова врста споразума показује како локална самоуправа може постати фундаментална веза између главних здравствених стратегија и стварности породица , подржавајући субјекте са искуством и коренима на територији.

Иницијативе солидарности које подижу свест и подржавају истраживање

Мрежа удружења повезаних са ретким болестима није ограничена само на пружање неге или заступање. Појављују се и пројекти који комбинују спорт, културу и друштвену свест како би се овим стањима пружила видљивост и прикупила средства за истраживање.

Фондација Рено групе Шпанија, путем свог интерног конкурса „Да ли сарађујете са невладином организацијом?“ , ове године је доделила награде неколико добротворних иницијатива које подржавају њени запослени. Међу њима је и удружење „На путу за ретке болести“ са седиштем у Паленсији, које организује планинске изазове, планинарске руте и друге догађаје како би прикупило средства и подигло свест о ретким болестима.

Основана 2018. године, организација делује под мотом „Учинити невидљиво видљивим “, са циљем да ове реалности приближи широј јавности и заложи се за право на истраживање. Донација од 4.000 евра са конкурса надовезује се на доприносе који су већ дати другим организацијама као што су ASPACE Valladolid и Cris Cancer Foundation.

Ове врсте корпоративних програма показују како компаније могу да каналишу посвећеност својих запослених друштвеним циљевима , обезбеђујући директно финансирање и, истовремено, видљивост ентитетима који често раде са веома ограниченим ресурсима.

Комбинација научних иновација, дигиталних алата, европских савеза и локалне подршке ствара слику у којој ретке болести почињу да добијају на значају на јавној агенди. Још увек је дуг пут – од поједностављивања дијагноза до обезбеђивања стабилних ресурса за најугроженије породице – али конвергенција истраживања, удружења и владиних агенција показује да одговор више не зависи од једног актера, већ од све шире и међусобно повезане мреже.

ретке болести
Повезани чланак:
Ретке болести: истраживање, приступ и солидарност у Шпанији

Додај као жељени извор на Гуглу